Биохимия
ISSN (print): 0320-9725
Свидетельство о регистрации СМИ: ПИ № ФС77–71478 от 23.11.2017
Учредитель: Российская академия наук
Главный редактор: Донцова Ольга Анатольевна, академик РАН, профессор, доктор химических наук
Число выпусков в год: 12
Индексация:
- РИНЦ,
- перечень ВАК,
- ядро РИНЦ,
- RSCI,
- Белый список (2 уровень)
В журнале «Биохимия» публикуются исследования по всем областям биохимии, а также исследования по биохимическим аспектам молекулярной биологии, биоорганической химии, микробиологии, иммунологии, физиологии и биомедицинских наук. Тематика журнала также охватывает новые экспериментальные методики, теоретические достижения, имеющие значение для биохимии, обзоры современных биохимических тем исследования, мини-обзоры, гипотезы и краткие сообщения.
Приветствуются материалы научно-исследовательских работ по следующим актуальным направлениям:
- Иммунология
- Иммунохимия
- Клеточная биология
- Нейробиология
- Энзимология, механизмы и кинетика ферментативных реакций
- Биоинформатика
- Прикладные аспекты биохимии (биотехнология)
- Протеомика
- Молекулярное моделирование
- Гликобиология, гликомика
- Липидология, обмен липидов
- Геномика и регуляция экспрессии генов
- РНК и рибосома
- Медицинская биохимия
- Молекулярная медицина
- Молекулярная эндокринология
- Биохимия крови и кардиология
- Биохимия мышц
- Онкология
- Проблемы развития, старения, эволюции
АУДИТОРИЯ
Журнал ориентирован на научных сотрудников, аспирантов, преподавателей университетов и средних школ, студентов и специалистов, работающих в научно-исследовательских институтах. Издание является источником информации для библиотек научно-исследовательских отделений университетов, биотехнологических и биомедицинских отделений вузов.
НАУКОМЕТРИЧЕСКИЕ ПОКАЗАТЕЛИ
Импакт-фактор РИНЦ (2021 г.): 2.908

НАУКОМЕТРИЧЕСКИЕ ПОКАЗАТЕЛИ ПЕРЕВОДНОЙ ВЕРСИИ
Импакт-фактор Web of Science (2021 г.): 2.824
Импакт-фактор Web of Science журнала Biochemistry (Moscow) в 2012–2021 гг.
SCImago Journal Rank (2020 г.): 0.747
Рейтинг SCImago Journal Rank журнала Biochemistry (Moscow) в 2013–2020 гг.
ИНДЕКСИРОВАНИЕ И РЕФЕРИРОВАНИЕ ПЕРЕВОДНОЙ ВЕРСИИ
- AGRICOLA
- ASFA
- Academic OneFile
- BIOSIS
- Biological Abstracts
- CAB (Abstracts, International)
- ChemWeb
- Chemical Abstracts Service (CAS)
- Current Contents/Life Sciences
- EBSCO
- EMBASE
- EMBiology
- Expanded Academic
- Food Science and Technology Abstracts (FSTA)
- Global Health
- Google Scholar
- Health Reference Center Academic
- Journal Citation Reports/Science Edition
- Medline
- OCLC
- Reaxys
- SCImago
- SCOPUS
- Science Citation Index, Science Citation Index Expanded
- Summon by ProQuest
Текущий выпуск



Том 90, № 1 (2025)
Статьи
4-Метилумбеллиферон, ингибитор гиалуронан-синтазы, препятствует развитию онкологических, воспалительных, дегенеративных и аутоиммунных заболеваний
Аннотация
Гиалуроновая кислота (ГК) является основным структурообразующим полимером внеклеточного матрикса. Метаболизм ГК играет важную роль в межклеточном взаимодействии в норме и при различных патологиях. Синтез ГК осуществляется гиалуронан-синтазами (HAS), представленными у млекопитающих тремя высокогомологичными изоформами HAS1, HAS2 и HAS3. До настоящего времени не описано высокоспецифичных конкурентных ингибиторов HAS. Наиболее широко применяется для ингибирования синтеза ГК in vivo и в культуре клеток 4-метилумбеллиферон (4-МУ), природное соединение кумаринового ряда. Обзор посвящен рассмотрению молекулярных основ терапевтического действия 4-МУ. Будут рассмотрены многочисленные эксперименты на культурах тканей, животных моделях заболеваний и первые клинические исследования с применением 4-МУ, доказывающие, что, наряду со многими рецепторами и транскрипционными факторами, основной фармакологической мишенью этого соединения является наиболее распространенная изоформа гиалуронан-синтазы HAS2, и именно с ингибированием синтеза ГК связаны фармакологические эффекты 4-МУ в онкологических, аутоиммунных, дегенеративных и гиперкомпенсированных регенеративных процессах (фиброз, образование шрамов). Новые клинические препараты на основе более специфичных ингибиторов HAS2 будут первыми в классе для лечения широкого ряда заболеваний.



Пересмотр представлений об эволюционном происхождении, функции и лечении рака
Аннотация
Несмотря на значительные достижения фундаментальной онкологии, практические результаты остаются неудовлетворительными. Это несоответствие отчасти объясняется исключительной сосредоточенностью исследователей на процессах внутри раковой клетки, что приводит к недооценке рака как системного заболевания. Очевидно, что необходим разумный баланс между двумя альтернативными методологическими подходами: редукционизмом, который предполагает разделение сложного явления на элементы, подлежащие детальному изучению, и холизмом, подчеркивающим необходимость изучения сложной системы как единого целого. Последовательный холистический подход приводит к представлению о раке как особом органе, что стимулирует обсуждение его функции и эволюционной роли. В статье рассматриваются следующие вопросы: рак как механизм очищающей селекции генофонда, соотношение между наследственным и спорадическим раком, раковый интерактом, роль метастазирования в летальном исходе. Предполагается, что нейтрализация ракового интерактома может стать альтернативной стратегией лечения злокачественных опухолей.



Портрет трёх бицистронных мРНК млекопитающих, которые происходят из генов ASNSD1, SLC35A4 и MIEF1
Аннотация
Последние достижения в области функциональной геномики позволили идентифицировать тысячи коротких открытых рамок считывания (sORF) в 5′-лидерах мРНК млекопитающих. Хотя большинство sORF, по всей видимости, не кодирует функциональные белки, установлено, что небольшое их количество эволюционирует как белок-кодирующие гены. В результате десятки таких sORF уже аннотированы как белок-кодирующие гены. мРНК, которые содержат и белок-кодирующую sORF, и аннотированную белок-кодирующую открытую рамку считывания, называют бицистронными. В этой работе рассматриваются три гена, ASNSD1, SLC35A4 и MIEF1, из которых происходят соответствующие бицистронные мРНК. Обсуждается функциональная роль соответствующих белковых продуктов и регуляция трансляции этих бицистронных мРНК, а также то, как такая необычная организация генов могла возникнуть в процессе эволюции.



Энергозависимое нефотохимическое тушение: PsbS, LhcSR и другие игроки
Аннотация
Для растений, обладающих высокочувствительным к свету фотосинтетическим аппаратом, приспособленным к улавливанию энергии света даже при слабых световых потоках, чрезвычайно опасны быстрые и значительные возрастания этого потока. Для решения проблем, вызываемых избыточной энергией падающего света, растения выработали целый ряд защитных механизмов, среди которых чрезвычайно важную роль играет нефотохимическое тушение возбуждённых состояний хлорофилла. Под нефотохимическим тушением, как правило, понимают совокупность различных механизмов, приводящих к сокращению времени жизни возбуждённых состояний хлорофилла в фотосинтетической антенне и тем самым к снижению эффективного воздействия света на весь фотосинтетический аппарат. Наиболее быстродействующий механизм нефотохимического тушения – так называемое энергозависимое тушение, которое активируется образованием трансмембранного протонного потенциала на тилакоидной мембране. Основные молекулярные игроки в этом механизме – кислородсодержащие каротиноиды ксантофиллы и белки тилакоидной мембраны: компонент антенны, LhcSR, у водорослей и мхов и компонент фотосистемы 2, PsbS, у высших растений и эволюционно наиболее близких к ним групп водорослей. Данный обзор посвящён молекулярным механизмам энергозависимого нефотохимического тушения, причём основной акцент сделан на PsbS-зависимом тушении. Установление того факта, что PsbS не связывает пигменты, породило представление о косвенной PsbS-зависимой активации тушения, т.е. о генерации центров тушения в других компонентах фотосинтетической антенны. В качестве механизмов такой активации в настоящее время рассматриваются: влияние PsbS на константы кислотной диссоциации аминокислотных остатков взаимодействующих с ним белков главной и малых антенн фотосистемы 2; влияние на конформацию каротиноидов в антенных белках; наконец, обсуждается роль PsbS как «мембранной смазки», увеличивающей подвижность главных антенн, LHCII, и обеспечивающей им возможность миграции в тилакоидной мембране и агрегации с последующим переходом в затушенное состояние.



Колокализация нейротрансмиттеров в гиппокампе и афферентных системах: возможная функциональная роль
Аннотация
В нейрофизиологии трансмиттерный фенотип считается признаком нейронной идентичности. С конца прошлого века стало известно, что нервная клетка может использовать для связи с другими нейронами несколько разных молекул. Это могут быть «классические» трансмиттеры: глутамат или гамма-аминомасляная кислота (либо ацетилхолин, серотонин, норадреналин), а также вторичные мессенджеры, в основном нейропептиды, выделяющиеся из тех же самых нейронов. Если классические нейромедиаторы совместно высвобождаются из одной и той же нервной клетки, говорят о котрансмиссии или корелизинге (выделении из одних и тех же везикул). В данной обзорной статье используется термин «котрансмиссия» в широком смысле, обозначая нейроны, которые высвобождают более одного классического медиатора. Поскольку трансмиттеры часто являются промежуточными продуктами метаболизма и обнаруживаются во многих клетках, классификация нейронов в настоящее время основана на белках-переносчиках (транспортерах), «упаковывающих» синтезируемые в цитоплазме нейромедиаторы в везикулы. Вопрос о колокализации основных нейротрансмиттеров у млекопитающих ограничивается здесь нейронами гиппокампа и тех структур, которые посылают к нему свои пути. В обзоре рассматриваются проблемы, затрагивающие механизмы мультитрансмиттерного сигналинга, а также вероятной функциональной роли колокализации медиаторов в работе гиппокампа. Предполагается, что коэкспрессия разных медиаторных фенотипов участвует в поддержании баланса возбуждения и торможения в разных регионах гиппокампа; способствует быстрому выбору способов обработки информации, индукции долговременной потенциации, поддержанию пространственного кодирования клетками места, а также обеспечению гибкости обучения и формированию рабочей памяти. Однако функциональная роль колокализации медиаторов, а также механизмов выделения «двойных» трансмиттеров окончательно не выяснены. Решение данных проблем продвинет некоторые направления фундаментальной нейронауки и поможет в терапии тех заболеваний, где обнаруживается нарушение баланса возбуждения и торможения, например эпилепсии, болезни Альцгеймера и многих других.



Роль β- и α-структур мембранных белков в изменении структуры плазмалеммы
Аннотация
Изменение структуры плазматических мембран влияет на функции мембран и клеток. Некоторые из этих изменений могут приводить к развитию патологий организма, что делает актуальной задачу изучения влияния изменений структуры мембран на их функции. В настоящее время установлено, что при взаимодействии гормонов стресса и андрогенов с плазматическими мембранами происходит изменение их структуры. При этом в плазмалеммах меняются взаимодействия между белками и липидами, образуется неподвижная квазипериодическая сеть белок-липидных доменов, связанная с цитоскелетом. Инициаторами образования белок-липидных доменов являются мембранные белки, которые изменили свою вторичную структуру при взаимодействии мембраны с гормонами. Вместе с тем всё ещё не ясно, какие именно изменения во вторичной структуре мембранных белков способствуют образованию вокруг них белок-липидных доменов. Целью данной работы являлось установление этих вторичных структур мембранных белков. Для достижения поставленной цели изучались изменения структуры мембран при их взаимодействии с дегидроэпиандростероном, кортизолом, андростероном, тестостероном и адреналином. В работе для изучения изменения структуры мембран использовались флуоресцентные методы измерения спектров возбуждения и испускания собственной флуоресценции мембранных белков и относительной микровязкости мембран с помощью зонда пирен. Изменение вторичной структуры мембранных белков при структурных переходах в мембранах изучалось с помощью ИК-спектроскопии. Установлено, что инициаторами появления белок-липидных доменов в плазматических мембранах являются мембранные белки, в которых после взаимодействия с гормонами увеличивается доля β-структур. При этом появление новых α-спиралей в мембранных белках не усиливает притяжение между мембранными белками, белок-липидные домены не образуются. Напротив, появление большого числа α-спиралей в мембранных белках может привести к уменьшению микровязкости липидного бислоя.



Оценка влияния ингибирования киназной активности LRRK2 на активность глюкоцереброзидазы на пациент-специфичных клетках пациентов с болезнью Гоше
Аннотация
Биаллельные мутации в гене GBA1, кодирующем лизосомный фермент глюкоцереброзидазу (GCase), приводят к развитию лизосомной болезни накопления, болезни Гоше (БГ), а также являются фактором высокого риска распространенного нейродегенеративного заболевания, болезни Паркинсона (БП). В большинстве случаев мутации в гене GBA1 локализуются вне активного сайта и приводят к снижению активности GCase из-за снижения эффективности транспорта фермента с измененной конформацией в лизосому. Препараты, которые применяются для терапии БГ (ферментозаместительная терапия), не способны проходить гематоэнцефалический барьер и не эффективны как для лечения нейрональных форм БГ, так и для БП, ассоциированной с мутациями в гене GBA1 (GBA1-БП). Для терапии БП на сегодняшний день проходят клинические испытания препараты, ингибирующие киназную активность обогащенной лейциновыми повторами киназы 2 (LRRK2). Ранее было показано, что ингибирование киназной активности LRRK2 приводит к увеличению активности GCase в пациент-специфичных клетках при GBA1-БП. Мы впервые оценили влияние ингибитора киназной активности LRRK2 (MLi-2) на активность GCase на первичной культуре макрофагов периферической крови, полученной от пациентов с БГ первого типа. Оценку активности GCase и уровня ее субстрата в клетках, культивируемых в присутствии и без MLi-2, проводили с использованием высокоэффективной жидкостной хроматографии в сочетании с тандемной масс-спектрометрией. Влияния ингибирования активности LRRK2 на активность GCasе в группе пациентов с БГ не выявлено.



Механизмы антиоксидантной защиты частиц липопротеидов низкой плотности от свободнорадикального окисления
Аннотация
Установлено, что при введении больным атеросклерозом per os препарата убихинона Q10 (СoQ10) окисленность (содержание липогидропероксидов) частиц липопротеидов низкой плотности (ЛНП) резко снижается, что подтверждает важную роль этого природного антиоксиданта в защите частиц ЛНП от свободнорадикального окисления (СРО) in vivo. Исследовано влияние липофильных природных антиоксидантов убихинола Q10 (СoQ10H2) и α-токоферола (α-ТОН) на кинетические параметры Cu2+-инициированного СРО частиц ЛНП. В этой модельной системе показана возможность синергизма антиоксидантного действия СoQ10H2 и α-ТОН. Обсуждаются вероятные механизмы регенерации липофильных антиоксидантов в частицах ЛНП, в том числе регенерация α-ТОН из токофероксильного радикала (α-ТО•) с участием СoQ10H2 и/или аскорбата.



Определение активности главной протеазы SARS-CoV-2 (Mpro) путём электроокисления остатка тирозина в модельном пептиде
Аннотация
Разработан подход для определения каталитической активности главной протеазы SARS-CoV-2 (Mpro), основанный на регистрации площади пика электрохимического окисления остатка тирозина модельного пептидного субстрата CGGGAVLQSGY, иммобилизованного на поверхности печатного графитового электрода (ПГЭ), модифицированного наночастицами золота (AuНЧ). AuНЧ были получены методом электросинтеза. Определены параметры стационарной кинетики Mpro по отношению к модельному пептиду: константа каталитическая (kcat) – (3,1 ± 0,1)·10−3 c−1; константа Михаэлиса (KM) – (358 ± 32)·10−9 М; эффективность катализа (kcat/KM) – 8659 c−1/М. Предел обнаружения (LOD) для Mpro с помощью разработанной электрохимической системы был определён как 44 нМ. Разработанный подход перспективен для поиска новых ингибиторов Mpro в качестве лекарственных препаратов для лечения коронавирусных инфекций.



Физиологические концентрации кальципротеиновых частиц запускают провоспалительную активацию эндотелиальных клеток и моноцитов
Аннотация
Супрафизиологические концентрации кальципротеиновых частиц (КПЧ), нейтрализующих избыточные ионы Ca2+ и PO43− в крови, индуцируют провоспалительную активацию эндотелиальных клеток (ЭК) и моноцитов. В настоящей работе мы определили физиологические уровни КПЧ (10 мкг/мл кальция, что соответствует увеличению концентрации Ca2+ в сыворотке или культуральной среде на 10%) и изучили, зависят ли патологические эффекты кальциевого стресса от формы доставки кальция (ионы Ca2+, альбуминовые или фетуиновые кальципротеиновые мономеры (КПМ-А/КПМ-Ф) и альбуминовые или фетуиновые кальципротеиновые частицы (КПЧ-А/КПЧ-Ф)). Добавление КПЧ-А или КПЧ-Ф к культурам ЭК приводило к повышению транскрипции провоспалительных генов (VCAM1, ICAM1, SELE, IL6, CXCL8, CCL2, CXCL1, MIF) и стимулировало секрецию провоспалительных цитокинов (IL-6, IL-8, MCP-1/CCL2 и MIP-3α/CCL20) и про- и антитромботических молекул (PAI-1 и uPAR) в человеческих артериальных ЭК и моноцитах, хотя эти эффекты зависели от типа клеток и формы КПЧ. Свободные ионы Ca2+ и КПМ-А/КПМ-Ф вызывали менее выраженные и стохастические патологические эффекты. Внутривенное введение CaCl2, КПМ-А или КПЧ-А крысам линии Wistar увеличивало продукцию хемокинов (CX3CL1, MCP-1/CCL2, CXCL7, CCL11, CCL17), гепатокинов (гепассоцин, фетуин-А, FGF-21, GDF-15), протеаз (MMP-2, MMP-3) и ингибиторов протеаз (PAI-1) в системный кровоток. На основании полученных данных был сделан вывод о том, что молекулярные последствия кальциевого стресса для ЭК и моноцитов в значительной степени определяются формой доставки кальция внутрь клетки, при этом патологические последствия минерального стресса возникают даже при физиологических концентрациях КПЧ.


